MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 12256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AGA	2	6	3	8	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014330	AAT	2	6	9	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014330	GTG	2	6	27	32	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014330	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014330	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014330	ATAA	2	8	124	131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014330	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014330	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014330	ATA	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014330	GAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014330	AAAAG	2	10	265	274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014330	AT	3	6	313	318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014330	TGT	2	6	327	332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014330	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014330	ATA	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014330	GAG	2	6	394	399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014330	A	6	6	493	498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014330	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014330	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014330	ATG	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014330	AT	4	8	554	561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014330	GAT	3	9	652	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014330	ATTA	2	8	675	682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014330	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014330	ATT	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014330	TGG	2	6	747	752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014330	T	8	8	773	780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014330	AAT	2	6	781	786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014330	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014330	GAT	3	9	829	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014330	T	6	6	844	849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014330	TTA	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014330	AAT	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014330	ATA	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014330	ATG	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014330	ATAA	2	8	946	953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014330	ATT	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014330	TAT	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014330	TGAT	2	8	1029	1036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014330	TAA	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014330	ATT	2	6	1085	1090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014330	TA	3	6	1115	1120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014330	A	6	6	1133	1138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014330	ATTTTT	2	12	1145	1156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014330	T	7	7	1152	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014330	A	6	6	1161	1166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014330	T	6	6	1208	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014330	TAA	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014330	A	6	6	2532	2537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014330	A	6	6	2558	2563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014330	T	6	6	2575	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014330	TAATT	2	10	3869	3878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014330	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014330	ATA	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014330	TTA	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014330	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014330	TATT	2	8	3940	3947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014330	TAG	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014330	T	6	6	3967	3972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014330	AT	3	6	4004	4009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014330	A	6	6	5141	5146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014330	TGT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014330	A	6	6	5165	5170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014330	TAA	2	6	5172	5177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014330	TA	4	8	5189	5196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014330	AGT	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014330	A	6	6	5226	5231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014330	AT	3	6	5234	5239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014330	ATA	2	6	5270	5275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014330	TA	3	6	5281	5286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014330	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014330	A	7	7	5299	5305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014330	TATT	2	8	5327	5334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014330	T	6	6	5748	5753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014330	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014330	AT	5	10	5814	5823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014330	TATAA	2	10	5846	5855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014330	TAA	2	6	7280	7285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014330	TTA	2	6	7289	7294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014330	A	7	7	7300	7306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014330	A	6	6	7316	7321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014330	TAA	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014330	TAA	3	9	10215	10223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014330	TAT	2	6	10226	10231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014330	AAG	2	6	10240	10245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014330	T	6	6	10573	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014330	TAT	2	6	10583	10588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014330	A	7	7	10611	10617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014330	TAA	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014330	A	6	6	10701	10706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014330	AAGT	2	8	10726	10733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014330	CGT	2	6	10736	10741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014330	T	7	7	10756	10762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014330	CAA	2	6	10773	10778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014330	AGA	3	9	10805	10813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014330	T	6	6	11268	11273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014330	T	6	6	11502	11507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014330	TAA	2	6	11518	11523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014330	T	6	6	13393	13398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014330	AGG	2	6	13400	13405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014330	A	6	6	14118	14123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014330	TAA	2	6	14146	14151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014330	T	6	6	14161	14166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014330	ATT	2	6	14167	14172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014330	A	6	6	14182	14187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014330	TAT	2	6	14194	14199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014330	TTA	2	6	14202	14207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014330	T	6	6	16599	16604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014330	A	6	6	16628	16633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014330	TAT	2	6	16655	16660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014330	AT	4	8	16659	16666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014330	AT	3	6	16673	16678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014330	TAAT	2	8	16682	16689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014330	TAT	2	6	16712	16717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014330	TAT	2	6	16726	16731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014330	ATT	2	6	18345	18350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014330	TTA	2	6	18356	18361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014330	TTTTTA	2	12	18389	18400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014330	TTA	2	6	18409	18414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014330	A	6	6	18416	18421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014330	GTA	2	6	18445	18450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014330	AT	3	6	18461	18466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014330	ATTTT	2	10	18493	18502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014330	T	6	6	18499	18504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014330	TA	3	6	19326	19331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014330	T	7	7	19387	19393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014330	T	6	6	20096	20101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014330	TGA	2	6	20106	20111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014330	TA	5	10	20122	20131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014330	ATTT	2	8	20446	20453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014330	T	6	6	20451	20456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014330	TA	4	8	20462	20469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014330	T	6	6	20478	20483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014330	TTA	2	6	22710	22715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014330	ATT	3	9	22725	22733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014330	TTAA	2	8	26365	26372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014330	ATA	2	6	26643	26648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014330	AT	3	6	26651	26656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014330	T	6	6	26656	26661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014330	A	6	6	26693	26698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014330	T	7	7	27419	27425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014330	ATT	2	6	27455	27460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014330	ATTT	2	8	27471	27478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014330	AAT	2	6	27482	27487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014330	TCA	2	6	27518	27523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014330	ATT	2	6	27571	27576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014330	ATA	2	6	27595	27600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014330	T	7	7	27613	27619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014330	AAT	2	6	27621	27626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014330	TTA	2	6	27648	27653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014330	ATC	2	6	27655	27660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014330	AGG	2	6	27667	27672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014330	T	6	6	27673	27678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014330	ATT	2	6	27684	27689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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